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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Milho e Sorgo. |
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Data corrente: |
02/12/2016 |
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Data da última atualização: |
11/04/2017 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
PEREIRA, G. da S.; LAPERUTA, L. D. C.; NUNES, E. S.; CHAVARRIA, L.; PASTINA, M. M.; GAZAFFI, R.; GERALDI, I. O.; GARCIA, A. A. F.; VIEIRA, M. L. C. |
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Afiliação: |
Guilherme da Silva Pereira, ESALQ; Larissa Di Cassia Laperuta, ESALQ; Endson Santana Nunes, ESALQ; Lourdes Chavarría, ESALQ; MARIA MARTA PASTINA, CNPMS; Rodrigo Gazaffi, Universidade Federal de São Carlos; Isaías Olívio Geraldi, ESALQ; Antonio Augusto Franco Garcia, ESALQ; Maria Lucia Carneiro Vieira, ESALQ. |
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Título: |
The sweet passion fruit (Passiflora alata) crop: genetic and phenotypic parameter estimates and QTL mapping for fruit traits. |
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Ano de publicação: |
2017 |
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Fonte/Imprenta: |
Tropical Plant Biology, v. 10, n. 1, p. 18-29, 2017. |
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DOI: |
10.1007/s12042-016-9181-4 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Despite their economic importance, some tropical crop species are largely neglected when it comes to conducting genetic studies characterizing target traits for breeding. Herein, genetic and phenotypic parameters as well quantitative trait loci (QTL) are described for the first time in a full-sib progeny of sweet passion fruit (Passiflora alata). A hundred F1 individuals were evaluated in two locations for seven fruit traits: diameter of fruit (DF, in mm), length of fruit (LF, in mm), weight of fruit (WF, in g), thickness of fruit skin (TS, in mm), weight of fruit skin (WS, in g), weight of fruit pulp (WP, in g) and soluble solids (SS, in °Brix). Mixed models fitted complex, unstructured genetic variance-covariance matrices for all traits in phenotypic analysis. Because of important genetic correlations among skin and pulp traits, multiplicative index selection to select the most promising individuals was successfully applied. A previously reported integrated map supported composite interval mapping (CIM) analyses. In total, we found 22 QTLs mapped in seven out of nine linkage groups. Heritabilities (from 59.8 % to 82.7 %) and proportion of phenotypic variance explained by the QTLs (from 42.0 % to 64.3 %) were comparable for each trait. Principal component analysis on TS, WS and WP showed that the first two principal components (PCs) accounted for 93.6 % of the total variability. CIM analyses on these two PCs revealed five putative QTLs controlling variation for these three traits simultaneously. Thus, genetic improvement for sweet passion fruit should be based on correlations between traits and QTL-related information can be a useful tool. MenosDespite their economic importance, some tropical crop species are largely neglected when it comes to conducting genetic studies characterizing target traits for breeding. Herein, genetic and phenotypic parameters as well quantitative trait loci (QTL) are described for the first time in a full-sib progeny of sweet passion fruit (Passiflora alata). A hundred F1 individuals were evaluated in two locations for seven fruit traits: diameter of fruit (DF, in mm), length of fruit (LF, in mm), weight of fruit (WF, in g), thickness of fruit skin (TS, in mm), weight of fruit skin (WS, in g), weight of fruit pulp (WP, in g) and soluble solids (SS, in °Brix). Mixed models fitted complex, unstructured genetic variance-covariance matrices for all traits in phenotypic analysis. Because of important genetic correlations among skin and pulp traits, multiplicative index selection to select the most promising individuals was successfully applied. A previously reported integrated map supported composite interval mapping (CIM) analyses. In total, we found 22 QTLs mapped in seven out of nine linkage groups. Heritabilities (from 59.8 % to 82.7 %) and proportion of phenotypic variance explained by the QTLs (from 42.0 % to 64.3 %) were comparable for each trait. Principal component analysis on TS, WS and WP showed that the first two principal components (PCs) accounted for 93.6 % of the total variability. CIM analyses on these two PCs revealed five putative QTLs controlling variation for these three ... Mostrar Tudo |
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Thesagro: |
Maracujá; Parâmetro genético. |
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Categoria do assunto: |
G Melhoramento Genético |
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Marc: |
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520 $aDespite their economic importance, some tropical crop species are largely neglected when it comes to conducting genetic studies characterizing target traits for breeding. Herein, genetic and phenotypic parameters as well quantitative trait loci (QTL) are described for the first time in a full-sib progeny of sweet passion fruit (Passiflora alata). A hundred F1 individuals were evaluated in two locations for seven fruit traits: diameter of fruit (DF, in mm), length of fruit (LF, in mm), weight of fruit (WF, in g), thickness of fruit skin (TS, in mm), weight of fruit skin (WS, in g), weight of fruit pulp (WP, in g) and soluble solids (SS, in °Brix). Mixed models fitted complex, unstructured genetic variance-covariance matrices for all traits in phenotypic analysis. Because of important genetic correlations among skin and pulp traits, multiplicative index selection to select the most promising individuals was successfully applied. A previously reported integrated map supported composite interval mapping (CIM) analyses. In total, we found 22 QTLs mapped in seven out of nine linkage groups. Heritabilities (from 59.8 % to 82.7 %) and proportion of phenotypic variance explained by the QTLs (from 42.0 % to 64.3 %) were comparable for each trait. Principal component analysis on TS, WS and WP showed that the first two principal components (PCs) accounted for 93.6 % of the total variability. CIM analyses on these two PCs revealed five putative QTLs controlling variation for these three traits simultaneously. Thus, genetic improvement for sweet passion fruit should be based on correlations between traits and QTL-related information can be a useful tool.
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Registro original: |
Embrapa Milho e Sorgo (CNPMS) |
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| 3. |  | BRAGA, M. F.; VIEIRA, M. L. C.; GAZAFFI, R.; GARCIA, A. A. F.; GIRALDI, I. O.; JUNQUEIRA, N. T. V. Mapeamento de QTL (quantitative trait loci) associados à resistência do maracujá-doce à bacteriose. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE FRUTICULTURA, 22., 2012, Bento Gonçalves. Anais... Bento Gonçalves: SBF, 2012.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Cerrados. |
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| 4. | | ROSÁRIO, M. F. do; GAZAFFI, R.; MOURA, A. S. A. M. T.; LEDUR, M. C.; GARCIA, A. A. F.; COUTINHO, L. L. Base genética da correlação entre características de desempenho e de rendimento de carcaça no cromossomo 1 da galinha. In: CONFERÊNCIA FACTA DE CIÊNCIA E TECNOLOGIA AVÍCOLAS, 2011, Santos, SP. Anais... Santos: FACTA, 2011. Trabalhos de Pesquisa José Maria Lamas da Silva. 1 CD-ROM. Projeto: 02.09.07.006.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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| 5. | | ROSÁRIO, M. F. do; GAZAFFI, R.; MOURA, A. S. A. M. T.; LEDUR, M. C.; COUTINHO, L. L.; GARCIA, A. A. S. Composite interval mapping and mixed models reveal QTL associated with performance and carcass traits on chicken chromosomes 1, 3, and 4. Journal of Applied Genetics, Pozna, on line 28 nov. 2013.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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| 6. | | LIMA, B. M.; TEIXEIRA, J. E. C.; GAZAFFI, R.; GARCIA, A. A. F.; GRATTAPAGLIA, D.; VALLE, R. K. D.; CAMARGO, L. E. A. Identification of a novel QTL contributing to rust resistance in Eucalyptus. BMC Proceedings 2011, v. 5, Suppl 7, p. P32, 2011. Edição dos resumos do IUFRO Tree Biotechnology Conference 2011: From Genomes to Integration, 2011 Arraial d?Ajuda, Bahia.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 7. | | FREITAS, E. G. de; PASTINA, M. M.; GAZAFFI, R.; PINTO, L. R.; XAVIER, M. A.; LANDELL, M. G. de A.; GARCIA, A. A. F. Modelos mistos para seleção de genótipos superiores e de futuros genitores de cana-de-açúcar. In: REUNIÃO ANUAL DA REGIÃO BRASILEIRA DA SOCIEDADE INTERNACIONAL DE BIOMETRIA, 58.; SIMPÓSIO DE ESTATÍSTICA APLICADA À EXPERIMENTAÇÃO AGRONÔMICA, 15., 2013, Campina Grande. Modelagem estatística em áreas multidisciplinares: impactos causados pelas mudanças climáticas na Região Nordeste: anais. Campina Grande: Sociedade Internacional de Biometria, 2013.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 8. | | ROSÁRIO, M. F. do; GAZAFFI, R.; MOURA, A. S. A. M. T.; LEDUR, M. C.; NONES, K.; GARCIA, A.; COUTINHO, L. L. Multitrait composite interval mapping reveals pleiotropic QTL on chicken chromosome 1. In: CONFERENCE OF THE INTERNATIONAL SOCIETY FOR ANIMAL GENETICS, 33., 2012, Cairns. Programme and abstract book... Cairns: ISAG, 2012. p.40.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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| 9. | | ANONI, C. A.; MANCINI, M. C.; COSTA, E. A.; GAZAFFI, R.; PASTINA, M. M.; PINTO, L. R.; SOUZA, A. P.; GARCIA, A. A. F. QTL mapping for yield related trait in a biparental cross of sugarcane. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 60., 2014, Guarujá. Resumos. Ribeirão Preto: Sociedade Brasileira de Genética, 2014. p. 126.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 10. | | ROSÁRIO, M. F.; GAZAFFI, R.; MOURA, A. S. A. M. T.; LEDUR, M. C.; COUTINHO, L. L.; GARCIA, A. A. F. QTLs associados a características de carcaça na galinha: mapeamento por intervalo vs mapeamento por intervalo composto. In: CONFERÊNCIA FACTA DE CIÊNCIA E TECNOLOGIA AVÍCOLAS, 27., 2009, Porto Alegre. Anais [dos] trabalhos de pesquisa José Maria Lamas de Silva. [Campinas]: FACTA, 2009. Projeto/Plano de Ação: 01.02.10.210-10. Publicado em CD-ROM (CD00156).| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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| 11. | | ROSÁRIO, M. F. do; GAZAFFI, R.; LEDUR, M. C.; MOURA, A. S. A. M. T.; BOSCHIERO, C.; COUTINHO, L. L.; GARCIA, A. A. F. G. QTL's mapeados para características de desempenho na galinha através do mapeamento por intervalo composto com modelo misto. In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO ANIMAL, 7., 2008, São Carlos, SP. Anais. São Carlos, SP: SBMA, 2008. 4 p. Projeto/Plano de Ação: 01.02.102.10-10.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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| 12. | | VIGNA, B. B. Z.; SANTOS, J. C.; PASTINA, M. M.; GAZAFFI, R.; MOLLINARI, M.; CANCADO, L. J.; VALLE, C. B. do; ANTONIO AUGUSTO FRANCO GARCIA; SOUZA, A. P. The Preliminary Genetic Linkage Map of hexaploid Brachiaria humidicola Based on Microsatellite Markers. In: INTERNATIONAL SYMPOSIUM ON FORAGE BREEDING, 3., 2011, Bonito, MS. Breeding forage for climate change adaptation and mitigation - eco-efficient animal produtction: proceedings. [Campo Grande, MS: Embrapa Gado de Corte], 2011. 42-45 1 CD-ROM| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 13. | | SILVA, F. E. de J.; GUIDO, L. N.; GAZAFFI, R.; GARCIA, A. A. F.; LEDUR, M. C.; COUTINHO, L. L.; ROSÁRIO, M. F. do. Regiões genômicas associadas a características de desempenho e carcaça no cromossomo 5 de linhagens brasileiras de galinha. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 46, n. 3, p. 229-238, 2011. Projeto: 01.06.01.006.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves; Embrapa Unidades Centrais. |
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| 15. | | PERSEGUINI, J. M. C. K.; CHIORATTO, A. F.; ZUCCHI, M. I.; COLOMBO, C. A.; CARBONELL, S. A. M.; MONDEGO, J. M. C.; GAZAFFI, R.; GARCIA, A. A. F.; CAMPOS, T. de; SOUZA, A. P. de; RUBIANO, L. B. Genetic diversity in cultivated carioca common beans based on molecular marker analysis. Genetics and Molecular Biology, Ribeirão Preto, v. 34, n. 1, p. 88-102, 2011.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Acre. |
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| 16. | | MORAIS, L. K. de; CURSI, D. E.; SANTOS, J. M. dos; SAMPAIO, M.; CAMARA, T. M. M.; SILVA, P. de A.; BARBOSA, G. V.; HOFFMANN, H. P; CHAPOLA, R. G.; FERNANDES JUNIOR, A. R.; GAZAFFI, R. Melhoramento genético da cana-de-açúcar. Aracaju: Embrapa Tabuleiros Costeiros, 2015. 40 p. (Embrapa Tabuleiros Costeiros. Documentos, 200).| Biblioteca(s): Embrapa Tabuleiros Costeiros. |
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| 17. | | PEREIRA, G. S.; NUNES, E. S.; LAPERUTA, L. D. C.; BRAGA, M. F.; PENHA, H. A.; DINIZ, A. L.; MUNHOZ, C. F.; GAZAFFI, R.; GARCIA, A. A. F.; VIEIRA, M. L. C. Molecular polymorphism and linkage analysis in sweet passion fruit, an outcrossing species. Annals of Applied Biology, v. 162, n. 3, p. 347-361, 2013.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
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| 18. | | COSTA, E. A.; ANONI, C. O.; MANCINI, M. C.; SANTOS, F. R. C.; MARCONI, T. G.; GAZAFFI, R.; PASTINA, M. M.; PERECIN, D.; MOLINARI, M.; XAVIER, M. A.; PINTO, L. R.; SOUZA, A. P.; GARCIA, A. A. F. QTL mapping including codominant SNP markers with ploidy level information in a sugarcane progeny. Euphytica, Dordrecht, v. 211, n. 1, p. 1-16, 2016.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 20. | | PEREIRA, G. da S.; LAPERUTA, L. D. C.; NUNES, E. S.; CHAVARRIA, L.; PASTINA, M. M.; GAZAFFI, R.; GERALDI, I. O.; GARCIA, A. A. F.; VIEIRA, M. L. C. The sweet passion fruit (Passiflora alata) crop: genetic and phenotypic parameter estimates and QTL mapping for fruit traits. Tropical Plant Biology, v. 10, n. 1, p. 18-29, 2017.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 2 |
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